Разница между днк и рнк-вирусами
Содержание:
Что пришло первым?
Хотя есть некоторые доказательства того, что ДНК, возможно, возникла первой, большинство ученых считают, что РНК развивалась до ДНК. РНК имеет более простую структуру и необходима для функционирования ДНК. Также РНК обнаружена у прокариот, которые, как полагают, предшествуют эукариотам. РНК сама по себе может служить катализатором определенных химических реакций.
Реальный вопрос в том, почему эволюционировала ДНК, если существовала РНК. Наиболее вероятным ответом на это является то, что наличие двухцепочечной молекулы помогает защитить генетический код от повреждения. Если одна нить сломана, другая может служить шаблоном для ремонта. Белки, окружающие ДНК, также обеспечивают дополнительную защиту от ферментативной атаки.
Нуклеиновая кислота: что это такое?
Для того чтобы составить таблицу сравнения ДНК и РНК, необходимо более подробно познакомиться с данными полинуклеотидами. Начнем с общего вопроса. И ДНК, и РНК — это нуклеиновые кислоты. Как говорилось ранее, они образуются из остатков нуклеотидов.
Эти полимеры можно обнаружить абсолютно в любой клеточке организма, так как именно на их плечи возложена большая обязанность, а именно:
- хранение;
- передача;
- реализация наследственности.
Теперь очень коротко осветим основные их химические свойства:
- хорошо растворяются в воде;
- практически не поддаются растворению в органических растворителях;
- чувствительны к изменениям температуры;
- если молекулу ДНК выделить каким-либо возможным образом из природного источника, то можно наблюдать фрагментацию при механических действиях;
- фрагментирование происходит ферментами под названием нуклеазы.
Что такое рибонуклеиновая кислота?
РНК — это нуклеиновая кислота с мономерами, называющимися рибонуклеотидами.
По химическим свойствам она очень похожа на ДНК, так как обе являются полимерами нуклеотидов, представляющих собой фосфолированный N-гликозид, который выстроен на остатке пентозы (пятиуглеродного сахара), с фосфатной группой пятого углеродного атома и основания азота при первом углеродном атоме.
Она представляет собой одну полинуклеотидную цепочку (кроме вирусов), которая намного короче, чем у ДНК.
Один мономер РНК — это остатки следующих веществ:
- основания азота;
- пятиуглеродного моносахарида;
- кислоты фосфора.
РНК имеют пиримидиновые (урацил и цитозин) и пуриновые (аденин, гуанин) основания. Рибоза является моносахаридом нуклеотида РНК.
Различия ДНК и РНК
- В основе мономеров дезоксирибонуклеиновой и рибонуклеиновой кислот – углевод – пентоза и рибоза соответственно.
- ДНК в своем составе содержит азотистое основание (пиримидиновое основание) – тимин, а РНК – урацил (отсутствует метильная группа).
- ДНК – двойная антипараллельная правозакрученная спираль, а РНК – одиночная цепь.
- ДНК способна удваиваться, а РНК – нет.
- Основные функции ДНК: Хранение, передача и реализация наследственной информации из поколения в поколение.
Основные функции РНК: Хранение генетической информации и синтез белка в клетке.
Молекула ДНК превышает в своих размерах и массе молекулу РНК.
Изначально людям казалось, что фундаментальной основой жизни являются белковые молекулы. Однако, научные исследования позволили выявить тот важный аспект, который отличает живую природу от неживой: нуклеиновые кислоты.
Транскрипция
Синтез всех молекул происходит во время транскрипции, то есть переписывании генетической информации с определенного оперона ДНК. Процесс в некоторых моментах похож на репликацию, а в других существенно отличается от нее.
Сходствами являются следующие части:
- начало идет с деспирализации ДНК;
- происходит разрыв водородных связей между основаниями цепей;
- к ним комплементарно подстраиваются НТФ;
- происходит образование водородных связей.
Отличия от репликации:
- при транскрипции расплетается лишь участок ДНК, соответствующий транскриптону, в то время как при репликации расплетению подвергается вся молекула;
- при транскрипции подстраивающиеся НТФ содержат рибозу, и вместо тимина урацил;
- информация списывается лишь с определенного участка;
- после образования молекулы водородные связи и синтезированная цепь разрываются, а цепь соскальзывает с ДНК.
Для нормального функционирования первичная структура РНК должна состоять только из списанных с экзонов ДНК-участков.
У только что образованных РНК начинается процесс созревания. Молчащие участки вырезаются, а информативные сшиваются, образуя полинуклеотидную цепь. Далее, каждый вид имеет присущие только ему превращения.
В и-РНК происходит присоединение к начальному концу. К конечному участку присоединяется полиаденилат.
В т-РНК модифицируются основания, образуя минорные виды.
У р-РНК также метилируются отдельные основания.
Защищают от разрушения и улучшают транспортировку в цитоплазму белки. РНК в зрелом состоянии с ними соединяются.
Строение и функции ДНК
ДНК — полимер, мономерами которой являются дезоксирибонуклеотиды. Модель пространственного строения молекулы ДНК в виде двойной спирали была предложена в 1953 г. Дж. Уотсоном и Ф. Криком (для построения этой модели они использовали работы М. Уилкинса, Р. Франклин, Э. Чаргаффа).
Молекула ДНК образована двумя полинуклеотидными цепями, спирально закрученными друг около друга и вместе вокруг воображаемой оси, т.е. представляет собой двойную спираль (исключение — некоторые ДНК-содержащие вирусы имеют одноцепочечную ДНК). Диаметр двойной спирали ДНК — 2 нм, расстояние между соседними нуклеотидами — 0,34 нм, на один оборот спирали приходится 10 пар нуклеотидов. Длина молекулы может достигать нескольких сантиметров. Молекулярный вес — десятки и сотни миллионов. Суммарная длина ДНК ядра клетки человека — около 2 м. В эукариотических клетках ДНК образует комплексы с белками и имеет специфическую пространственную конформацию.
Мономер ДНК — нуклеотид (дезоксирибонуклеотид) — состоит из остатков трех веществ: 1) азотистого основания, 2) пятиуглеродного моносахарида (пентозы) и 3) фосфорной кислоты. Азотистые основания нуклеиновых кислот относятся к классам пиримидинов и пуринов. Пиримидиновые основания ДНК (имеют в составе своей молекулы одно кольцо) — тимин, цитозин. Пуриновые основания (имеют два кольца) — аденин и гуанин.
Моносахарид нуклеотида ДНК представлен дезоксирибозой.
Название нуклеотида является производным от названия соответствующего основания. Нуклеотиды и азотистые основания обозначаются заглавными буквами.
| Азотистое основание | Название нуклеотида | Обозначение |
|---|---|---|
| Аденин | Адениловый | А (A) |
| Гуанин | Гуаниловый | Г (G) |
| Тимин | Тимидиловый | Т (T) |
| Цитозин | Цитидиловый | Ц (C) |
Полинуклеотидная цепь образуется в результате реакций конденсации нуклеотидов. При этом между 3′-углеродом остатка дезоксирибозы одного нуклеотида и остатком фосфорной кислоты другого возникает фосфоэфирная связь (относится к категории прочных ковалентных связей). Один конец полинуклеотидной цепи заканчивается 5′-углеродом (его называют 5′-концом), другой — 3′-углеродом (3′-концом).
Против одной цепи нуклеотидов располагается вторая цепь. Расположение нуклеотидов в этих двух цепях не случайное, а строго определенное: против аденина одной цепи в другой цепи всегда располагается тимин, а против гуанина — всегда цитозин, между аденином и тимином возникают две водородные связи, между гуанином и цитозином — три водородные связи. Закономерность, согласно которой нуклеотиды разных цепей ДНК строго упорядоченно располагаются (аденин — тимин, гуанин — цитозин) и избирательно соединяются друг с другом, называется принципом комплементарности. Следует отметить, что Дж. Уотсон и Ф. Крик пришли к пониманию принципа комплементарности после ознакомления с работами Э. Чаргаффа. Э. Чаргафф, изучив огромное количество образцов тканей и органов различных организмов, установил, что в любом фрагменте ДНК содержание остатков гуанина всегда точно соответствует содержанию цитозина, а аденина — тимину («правило Чаргаффа»), но объяснить этот факт он не смог.
Из принципа комплементарности следует, что последовательность нуклеотидов одной цепи определяет последовательность нуклеотидов другой.
Цепи ДНК антипараллельны (разнонаправлены), т.е. нуклеотиды разных цепей располагаются в противоположных направлениях, и, следовательно, напротив 3′-конца одной цепи находится 5′-конец другой. Молекулу ДНК иногда сравнивают с винтовой лестницей. «Перила» этой лестницы — сахарофосфатный остов (чередующиеся остатки дезоксирибозы и фосфорной кислоты); «ступени» — комплементарные азотистые основания.
Функция ДНК — хранение и передача наследственной информации.
Что такое нуклеиновые кислоты
Если вы впервые столкнулись с данными аббревиатурами, то стоит познакомиться с их расшифровкой. ДНК — дезоксирибонуклеиновая кислота. Всем известно, что она охватывает информацию о генах клеток. РНК — рибонуклеиновая кислота. Ее основной функцией является формирование белка. Это органическое вещество, являющееся основой всего живого. Однако это не все различие. РНК от ДНК отличается не только лишь наименованиями и областями использования.
Вещества, о которых идет речь в нашей статье, называют нуклеиновыми кислотами. Больше всего их в ядерном матриксе, там они и были впервые найдены. С течением времени стало очевидным, что размещаются они в разных частях клеток. Пластиды разных видов, митохондрии, а также цитоплазма содержат эти вещества. Но название они получили от латинского слова «нуклеус», что в переводе означает «ядро».
Как и все органические вещества, нуклеиновые кислоты представляют собой природные естественные биополимеры. Это крупные макромолекулы, состоящие из определенного количества циклически повторяющихся одинаковых элементов — мономеров. К примеру, у сложных углеводов это моносахариды.
Информационная рибонуклеиновая кислота
Такие молекулы еще называют матричными. Они составляют в клетке примерно два процента от всего количества. В клетках эукариот они синтезируются в ядрах на ДНК-матрицах, переходя затем в цитоплазму и связываясь с рибосомами. Далее, они становятся матрицами для синтеза белка: к ним присоединяются транспортные РНК, которые несут аминокислоты. Так происходит процесс преобразования информации, которая реализуется в уникальной структуре белка. В некоторых вирусных РНК она к тому же является хромосомой.
Жакоб и Мано являются открывателями этого вида. Не имея жесткой структуры, ее цепь образует изогнутые петли. Не работая, и-РНК собирается в складки и сворачивается в клубок, а в рабочем состоянии разворачивается.
и-РНК несет в себе информацию о последовательности аминокислот в белке, который синтезируется. Каждая аминокислота закодирована в определенном месте при помощи генетических кодов, которым свойственны:
- триплетность — из четырех мононуклеотидов возможно выстроить шестьдесят четыре кодона (генетического кода);
- неперекрещиваемость — информация движется в одном направлении;
- непрерывность — принцип работы сводится к тому, что одна и-РНК — один белок;
- универсальность — тот или иной вид аминокислоты кодируется у всех живых организмов одинаково;
- вырожденность — известными являются двадцать аминокислот, а кодонов — шестьдесят один, то есть они кодируются несколькими генетическими кодами.
Дезоксирибонуклеиновая кислота
ДНК это биополимер. В основе мономера ДНК – пентоза. Углевод ДНК является исключением из правил, ведь его формула (C5H10O4) отличается от «нормального» углевода тем, что в ней отсутствует один атом кислорода, поэтому этот углевод получил название «дезоксирибоза».
К остатку дезоксиробозы присоединено одно азотистое основание (цитозин, тимин, аденин и гуанин). Полимерная цепь ДНК образуется путем связывания между собой мономеров. Сшиваются между собой соседние «звенья» остатками фосфорной кислоты, образуя фосфодиэфирную 3’-5’ – связь.
ДНК – это двойная антипараллельная правозакрученная спираль. Две цепи соединены водородными связями, которые возникающими между гетероциклическими соединениями. В ДНК комплементарные пары: A-G и C-T.
Уникальность ДНК в том, что она способна создавать дочернюю молекулу (репликация
). Для этого спираль ДНК расходится на две материнские цепи и с помощью ферментов (основной фермент это ДНК-полимераза) на них выстраиваются дочерние цепи, основываясь на правиле комплементарности. В итоге образуется две идентичные друг другу цепи ДНК. Этот процесс обеспечивает безошибочную передачу наследственной информации из поколения в поколение.
Рибосомальная рибонуклеиновая кислота
Такие молекулы составляют подавляющее большинство клеточных РНК, а именно от восьмидесяти до девяноста процентов от общего количества. Они соединяются с белками и формируют рибосомы — это органоиды, выполняющие синтез белков.
Рибосомы состоят на шестьдесят пять процентов из р-РНК и на тридцать пять процентов из белка. Эта полинуклеотидная цепь без труда изгибается вместе с белком.
Рибосома состоит из аминокислотного и пептидного участков. Они расположены на контактирующих поверхностях.
Рибосомы свободно передвигаются в клетке, синтезируя белки в нужных местах. Они не очень специфичны и могут не только считывать информацию с и-РНК, но и образовывать с ними матрицу.
Дезоксирибонуклеиновая кислота
ДНК это биополимер. В основе мономера ДНК – пентоза. Углевод ДНК является исключением из правил, ведь его формула (C5H10O4) отличается от «нормального» углевода тем, что в ней отсутствует один атом кислорода, поэтому этот углевод получил название «дезоксирибоза».
К остатку дезоксиробозы присоединено одно азотистое основание (цитозин, тимин, аденин и гуанин). Полимерная цепь ДНК образуется путем связывания между собой мономеров. Сшиваются между собой соседние «звенья» остатками фосфорной кислоты, образуя фосфодиэфирную 3’-5’ – связь.
ДНК – это двойная антипараллельная правозакрученная спираль. Две цепи соединены водородными связями, которые возникающими между гетероциклическими соединениями. В ДНК комплементарные пары: A-G и C-T.
Уникальность ДНК в том, что она способна создавать дочернюю молекулу (репликация). Для этого спираль ДНК расходится на две материнские цепи и с помощью ферментов (основной фермент это ДНК-полимераза) на них выстраиваются дочерние цепи, основываясь на правиле комплементарности. В итоге образуется две идентичные друг другу цепи ДНК. Этот процесс обеспечивает безошибочную передачу наследственной информации из поколения в поколение.
Модель ДНК Уотсона-Крика
Б 1953 г. Джеймс Уотсон и Фрэнсис Крик, основываясь на данных рентгеноструктурного анализа кристаллов ДНК, пришли к выводу, что нативная ДНК состоит из двух полимерных цепей, образующих двойную спираль (рисунок 3).
Навитые одна на другую полинуклеотидные цепи удерживаются вместе водородными связями, образующимися между комплементарными основаниями противоположных цепей (рисунок 3). При этом аденин образует пару только с тимином, а гуанин — с цитозином. Пара оснований А—Т стабилизируется двумя водородными связями, а пара G—С — тремя.
Длина двухцепочечной ДНК обычно измеряется числом пар комплементарных нуклеотидов (п.н.). Для молекул ДНК, состоящих из тысяч или миллионов пар нуклеотидов, приняты единицы т.п.н. и м.п.н. соответственно. Например, ДНК хромосомы 1 человека представляет собой одну двойную спираль длиной 263 м.п.н.
Сахарофосфатный остов молекулы, который состоит из фосфатных групп и дезоксирибозных остатков, соединенных 5’—З’-фосфодиэфирными связями, образует «боковины винтовой лестницы», а пары оснований А—Т и G—С — ее ступеньки (рисунок 3).
Рисунок 3: Модель ДНК Уотсона-Крика
Цепи молекулы ДНК антипараллельны: одна из них имеет направление 3’→5′, другая 5’→3′. В соответствии с принципом комплементарности, если в одной из цепей имеется нуклеотидная последовательность 5-TAGGCAT-3′, то в комплементарной цепи в этом месте должна находиться последовательность 3′-ATCCGTA-5′. В этом случае двухцепочечная форма будет выглядеть следующим образом:
- 5′-TAGGCAT-3′
- 3-ATCCGTA-5′.
В такой записи 5′-конец верхней цепи всегда располагают слева, а 3′-конец — справа.
Носитель генетической информации должен удовлетворять двум основным требованиям: воспроизводиться (реплицироваться) с высокой точностью и детерминировать (кодировать) синтез белковых молекул.
Модель ДНК Уотсона—Крика полностью отвечает этим требованиям, так как:
- согласно принципу комплементарности каждая цепь ДНК может служить матрицей для образования новой комплементарной цепи. Следовательно, после одного раунда репликации образуются две дочерние молекулы, каждая из которых имеет такую же нуклеотидную последовательность, как исходная молекула ДНК.
- нуклеотидная последовательность структурного гена однозначно задает аминокислотную последовательность кодируемого ею белка.
Что такое РНК
Рибонуклеиновая кислота или РНК в основном находится в цитоплазме. Некоторые могут также быть найдены в ядре. Многие вирусы хранят свою генетическую информацию в геномах РНК. РНК играет жизненно важную роль в регуляции и экспрессии генов.
РНК представляет собой полинуклеотид, состоящий из нуклеотидных мономеров, таких же, как ДНК. РНК имеет гораздо более короткую цепь по сравнению с ДНК. Рибоза — это сахар, который образует сахарно-фосфатный остов. Рибоза очень реактивна благодаря гидроксильной группе в положении 2 ‘пентозного кольца. Следовательно, РНК нестабильна в щелочных условиях. Благодаря наличию 2’-ОН-группы РНК существует в A-форме. Геометрия A-формы создает глубокую узкую крупную канавку и неглубокую широкую малую канавку. Четыре азотистых основания, найденные в РНК, представляют собой цитозин (C), гуанин (G), аденин (A) и урацил (U). В отличие от ДНК, РНК существует в виде одноцепочечной молекулы в большинстве случаев, но она может образовывать двухцепочечные вторичные структуры, такие как петли шпильки, путем комплементарного спаривания оснований; Аденин (A) сочетается с урацилом (U), а цитозин (C) — с гуанином (G).
Большинство функциональных форм РНК имеют третичную структуру. Наиболее биологически активными типами РНК являются мессенджер РНК (мРНК), трансферная РНК (тРНК), рибосомная РНК (рРНК), малая ядерная РНК (snRNA) и другие некодирующие РНК (нкРНК). МРНК, тРНК и рРНК связаны с синтезом белка. НкРНК участвует в процессинге РНК и регуляции генов. Некоторые РНК, такие как рибозимы, способны катализировать химические реакции. Небольшие интерферирующие РНК (миРНК) играют жизненно важную роль в регуляции генов посредством интерференции РНК. Транскрипция — это процесс, в котором происходит синтез РНК с использованием ДНК в качестве матрицы. РНК-полимераза является ферментом, который катализирует реакцию. РНК не повреждается ультрафиолетом легко.
Принципы строения ДНК
Еще одна важная особенность — наличие четырех уровней организации (вы сможете это увидеть на картинке). Как уже стало понятно, первичная структура — это цепочка нуклеотидов, при этом соотношение азотистых оснований подчиняется некоторым законам.
Вторичная структура — двойная спираль, состав каждой цепи которой специфичен для вида. Остатки фосфорной кислоты мы можем обнаружить снаружи спирали, а азотистые основания располагаются внутри.
Далее идет суперспирализованная структура. Помимо сплетения двух цепей, они наматываются на гистоны (для большей компактности). Гистоны — это специальные белки, которые делятся на пять классов.
Последним уровнем выступает хромосома. Представьте, что Эйфелева башня помещается в спичечный коробок, вот так уложена молекула ДНК в хромосоме
Важно заметить еще и то, что хромосома может состоять из одной хроматиды или двух
Поговорим, прежде чем составить таблицу сравнения ДНК и РНК, о структуре РНК.
Рибонуклеи́новая кислота
РНК имеет ряд отличий от ДНК, однако их строение кардинально не различается. Во-первых, РНК составляют «нормальные» углеводы – рибозы (C5H10O5). Во-вторых, взамен гетероциклического основания тимина в состав РНК входит урацил, лишенный метильной группы.
РНК – одиночная полимерная цепь, которая при благоприятных условиях способна изменять свою конфигурацию и приобретать форму «шпильки», когда ближайшие азотистые основания, комплементарные друг другу, связываются. В РНК следующие основания образуют пары: A-G и U-C. РНК в несколько раз короче спирали ДНК.
Следует упомянуть о типах РНК. Выделяют матричную или информационную РНК (мРНК), транспортную РНК (тРНК), рибосомальную РНК (рРНК), транспортно-матричные РНК (тмРНК) и малые ядерные РНК (мяРНК). Функции их различны, но все они необходимы для жизни. РНК — это основа для биосинтеза белка, поскольку ДНК не присутствует в цитоплазме, где на рибосомах происходит синтез белковых молекул.
Стоит отметить, что процесс синтеза белка начинается с ДНК, где зашифрована информация о конкретном веществе, поскольку ДНК – это источник генной информации. РНК берет свое начало на ДНК, синтезируясь на ней при помощи специального фермента.
Разобрав по отдельности две нуклеиновые кислоты, можно переходить к подведению итогов. Что же объединяет ДНК и РНК и в чем заключается их кардинальное различие?
Что такое РНК-вирусы
РНК-вирусы относятся к вирусам, генетическая информация которых хранится в форме РНК. Большинство РНК-вирусов содержат одноцепочечную РНК, а некоторые содержат двухцепочечную РНК. РНК-вирусы содержат небольшие геномы по сравнению с ДНК-вирусами. Это связано с ошибочной репликацией в РНК-вирусах. Некоторые ДНК и РНК-вирусы показаны на фигура 2.
Рисунок 2: ДНК и РНК Вирусы
Классы РНК-вирусов
|
Учебный класс |
Тип нуклеиновой кислоты |
семья |
Биосинтез |
|
Класс III |
Двухцепочечная РНК |
Reoviridae (двойной капсид, без оболочки) |
Вирусный фермент копирует нить антисмысловой РНК, превращая мРНК в цитоплазму |
|
Класс IV |
Одноцепочечная РНК (смысловая цепь) |
Picornaviridae (без оболочки) Togaviridae (в оболочке) |
Вирусная РНК функционирует как матрица для синтеза РНК-полимеразы, которая копирует антисмысловую цепь РНК для образования мРНК в цитоплазме. |
|
Класс V |
Одноцепочечная РНК (антисмысловая цепь) |
Rhabdoviridae (в оболочке) |
Вирусный фермент копирует вирусную РНК, чтобы сделать мРНК в цитоплазме |
|
Класс VI |
Одноцепочечная РНК (смысловая цепь) обратной транскриптазы (РНК-зависимая ДНК-полимераза) |
Retroviridae (в оболочке) |
Вирусный фермент копирует вирусную РНК для образования ДНК в цитоплазме; ДНК движется к ядру |
Что такое экстракция ДНК
Выделение ДНК — это процедура выделения и очистки ДНК. ДНК может быть выделена из крови, замороженных образцов ткани или блоков парафиновой ткани. Три этапа выделения ДНК — лизис клеток, выделение ДНК и осаждение. Во время лизиса клеток барьеры клеточной мембраны, такие как клеточная мембрана и мембраны ядра, распадаются, чтобы обнажить ДНК. Следующим этапом является удаление мембранных липидов из образца. Наконец, осаждение ДНК включает удаление ДНК-ассоциированных белков протеазой и удаление РНК с помощью РНКазы.
Рисунок 1: Процедура извлечения ДНК
Основные протоколы экстракции ДНК
Ниже показаны основные протоколы выделения ДНК.
1. Клеточный лизис с помощью буфера для лизиса клеток для лизирования клеточных мембран.
2. Липиды расщепляются с помощью моющих и поверхностно-активных веществ
3. Переваривание белков путем добавления протеазы
4. Расщепление РНК путем добавления РНКазы
5. Разделение клеточного дебриса, расщепленных белков, липидов и РНК путем добавления концентрированной соли с последующим центрифугированием.
6. Осаждение ДНК этанолом ледяным этанолом или изопропанолом. Ионная сила ацетата натрия может быть использована для улучшения осаждения. Осажденная ДНК появляется в виде нитей в конечном растворе.
Рисунок 2: Извлеченная ДНК
Экстракция фенол-хлороформом также может быть использована для отделения ДНК от белков. Здесь фенол денатурирует белки в образце, и ДНК остается в водной фазе в конце экстракции. И в органической фазе вы можете найти денатурированные белки. Другой метод извлечения ДНК — очистка миниколонок. Здесь связывание ДНК в колонке зависит от pH и концентрации соли в буфере.
Что такое ДНК?
ДНК (дезоксирибонуклеиновая кислота) – это макромолекула, которая хранит в себе и передает из поколения в поколение наследственную информацию. В клетках же основная функция молекулы ДНК – это сохранение точной информации о строении белков и РНК. У животных и растений молекула ДНК содержится в составе ядра клетки, в хромосомах. Чисто с химической точки зрения молекула ДНК состоит из фосфатной группы и азотистого основания. В пространстве она представлена как две спирально закрученные нити. Азотистые основания – это аденин, гуанин, цитозин и тимин, причем соединяются они между собой только по принципу комплиментарности – гуанин с цитозином, а аденин с тимином. Расположение нуклеотидов в различной последовательности позволяет кодировать различную информацию о типах РНК, участвующих в процессе синтеза белка.
Что такое мРНК
МРНК (мессенджер РНК) относится к подтипу РНК, который создается путем транскрипции и определяет аминокислотную последовательность белка. Следовательно, это транскрипт гена. У эукариот мРНК продуцируется внутри ядра и транспортируется в цитоплазму. Фермент, ответственный за синтез мРНК во время транскрипции, представляет собой РНК-полимеразу. Молекула мРНК состоит из нуклеотидов РНК. Аденин (A), гуанин (G), цитозин (C) и урацил (U) являются четырьмя нуклеотидами РНК, найденными в молекуле мРНК. Вновь синтезированная мРНК называется пре-мРНК, который подвергается посттранскрипционным модификациям с образованием зрелой молекулы мРНК. Он включает в себя добавление 5 ‘шапки, редактирование и полиаденилирование. Структура зрелой молекулы мРНК показана на фигура 2.
Рисунок 2: зрелая мРНК
Колпачок 7-метилгуанозина добавляют к передней части 5′-конца. Во время редактирования мРНК некоторые нуклеотиды могут быть изменены. Поли (А) хвост, который содержит около 250 аденозиновых остатков, добавляется на 3′-конце молекулы мРНК, чтобы защитить его от деградации экзонуклеазами. С другой стороны, пре-мРНК эукариот состоит из интронов и экзонов. Альтернативный сплайсинг — это еще один процесс, с помощью которого различные комбинации экзонов сплайсируются вместе для получения нескольких типов белков из одной молекулы пре-мРНК. МРНК прокариот способна продуцировать белок одного типа после трансляции. Функция молекулы мРНК показана на рисунок 3.
Рисунок 3: Роль мРНК в клетке
Зрелые молекулы мРНК экспортируются через ядерные поры в цитоплазму. Зрелая мРНК транслируется в аминокислотную последовательность конкретного белка в процессе, называемом трансляцией. Трансляция облегчается рибосомами в цитоплазме. Транскрипция последовательности ДНК в молекулу мРНК и перевод молекулы мРНК в белок называются центральной догмой молекулярной биологии. Кодирующая область каждой молекулы мРНК состоит из кодонов, которые представляют собой три нуклеотида, представляющих определенную аминокислоту полипептидной цепи.
Достоинства и недостатки метода ПЦР
Современные методы позволяют точно подобрать набор веществ, нужных для реакции, а значит, «достроить» именно ДНК SARS-Cov-2, а не другого похожего.
Теперь о недостатках. Первое — относительно высокая цена. Она обусловлена высокой себестоимостью как праймеров, так и оборудования – амплификаторов. Второе — время. Ждать, пока размножится ДНК, нужно несколько часов, а с учетом транспортировки до лаборатории результаты теста пациент может узнать через сутки и более.
Также эффективность теста не превышает 80%. Праймеры для реакции подбираются на основе информации об РНК вируса. Но фрагмент с теми же «буквами» может оказаться и в других микроорганизмах пробы – отсюда ложноположительный результат. Ложноотрицательный результат получится, если вирусные частицы ушли из ротоглотки, спустились дальше по дыхательному пути. Тогда в пробе просто не окажется РНК вируса.
Сдавать тест ПЦР есть смысл в том случае, если человек контактировал с пациентом с подтвержденным коронавирусом.
Основное отличие — ДНК против РНК-полимеразы
ДНК является генетическим материалом практически всех живых организмов. ДНК-полимераза и РНК-полимераза — это два фермента, которые работают на ДНК. ДНК-полимераза — это фермент, используемый при репликации ДНК, а РНК-полимераза — это фермент, используемый в транскрипции. Оба фермента способны образовывать фосфодиэфирные связи между нуклеотидами. Направление полимеризации происходит от 5 ’до 3’. ДНК-полимераза требует праймера для инициации полимеризации, в то время как РНК-полимеразы не требуют праймера. главное отличие между ДНК и РНК-полимеразой является то, что ДНК-полимераза продуцирует двухцепочечную молекулу ДНК во время полимеризации, тогда как РНК-полимераза продуцирует одноцепочечную молекулу РНК во время транскрипции.
Ключевые области покрыты
1. Что такое ДНК-полимераза — определение, репликация ДНК, процесс2. Что такое РНК-полимераза — Определение, Транскрипция, Процесс3. Каковы сходства между ДНК и РНК-полимеразой — Краткое описание общих черт4. В чем разница между ДНК и РНК-полимеразой — Сравнение основных различий
Ключевые слова: ДНК, ДНК-полимераза, ДНК-репликация, РНК, РНК-полимераза, транскрипция

14 . Рибонуклеиновые кислоты, их виды, строение, назначение.
РНК —
класс нуклеиновых
кислот,линейных полимеровнуклеотидов,
в состав которых входят остаток фосфорной
кислоты, рибоза (в отличие отДНК,
содержащей дезоксирибозу) и азотистые
основания -аденин,цитозин,гуанини
урацил (в отличие от ДНК, содержащий
вместо урацила тимин). Эти молекулы
содержатся в клетках всех живых
организмов, а также в некоторых
вирусов.
РНК содержатся главным образом
вцитоплазме
клеток. Эти
молекулы синтезируются в клетках всех
клеточных живых организмов, а также
содержатся в вироидах и некоторых
вирусах.
Основные функции РНК в
клеточных организмах — это шаблон для
трансляции генетической информации в
белки и поставка соответствующих
аминокислот к рибосомам. В вирусах
является носителем генетической
информации (кодирует белки оболочки и
ферменты вирусов).
Структура
РНК.
Молекула
имеет однонитевое строение. Полимер. В
результате взаимодействия нуклеотидов
друг с другом молекула РНК приобретает
вторичную структуру, различной формы
(спираль, глобула и т.д.). Мономером РНК
является нуклеотид (молекула, в состав
которой входит азотистое основание,
остаток фосфорной кислоты и сахар
(пептоза)). РНК напоминает по своему
строению одну цепь ДНК. Нуклеотиды,
входящие в состав РНК: гуанин, аденин,
цитозин, урацил. Аденин и гуанин относятся
к пуриновым основаниям, цитозин и урацил
к пиримидиновым. В отличие от молекулы
ДНК, в качестве углеводного компонента
рибонуклеиновой кислоты выступает не
дезоксирибоза, а рибоза. Вторым
существенным отличием в химическом
строении РНК от ДНК является отсутствие
в молекуле рибонуклеиновой кислоты
такого нуклеотида как тимин. В
РНК он заменён на урацил.
Виды
и типы РНК клеток.
Существуют
три типа РНК, каждый из которых выполняет
свою особую роль в синтезе белка.
1.
Матричная
РНК
переносит генетический код из ядра в
цитоплазму, определяя таким образом
синтез разнообразных белков.
2.
Транспортная
РНК
переносит активированные аминокислоты
к рибосомам для синтеза полипептидных
молекул.
3.
Рибосомная
РНК
в комплексе примерно с 75 разными белками
формирует рибосомы — клеточные органеллы,
на которых происходит сборка полипептидных
молекул.
Матричная
РНК
представляет собой длинную одноцепочечную
молекулу, присутствующую в цитоплазме.
Эта молекула РНК содержит от нескольких
сотен до нескольких тысяч нуклеотидов
РНК, образующих кодоны, строго
комплементарные триплетам ДНК.
Еще
один тип РНК, играющий важнейшую роль
в синтезе белка, называют транспортной
РНК,
поскольку он транспортирует аминокислоты
к строящейся молекуле белка. Каждая
транспортная РНК специфически связывается
только с одной из 20 аминокислот,
составляющих белковые молекулы.
Транспортные РНК действуют как переносчики
специфических аминокислот, доставляя
их к рибосомам, на которых происходит
сборка полипептидных молекул.
Каждая
специфическая транспортная РНК распознает
«свой» кодон матричной РНК, прикрепившейся
к рибосоме, и доставляет соответствующую
аминокислоту на соответствующую позицию
в синтезируемой полипептидной цепи.
Цепь транспортной РНК гораздо короче
матричной РНК, содержит всего около 80
нуклеотидов и упакована в форме клеверного
листа. На одном конце транспортной РНК
всегда находится аденозинмонофосфат
(АМФ), к которому через гидроксильную
группу рибозы прикрепляется транспортируемая
аминокислота. Транспортные РНК служат
для прикрепления специфических
аминокислот к строящейся полипептидной
молекуле, поэтому необходимо, чтобы
каждая транспортная РНК обладала
специфичностью и в отношении соответствующих
кодонов матричной РНК. Код, посредством
которого транспортная РНК распознает
соответствующий кодон на матричной
РНК, также является триплетом и его
называют антикодоном. Антикодон
располагается примерно посередине
молекулы транспортной РНК. Во время
синтеза белка азотистые основания
антикодона транспортной РНК прикрепляются
с помощью водородных связей к азотистым
основаниям кодона матричной РНК. Таким
образом, на матричной РНК выстраиваются
в определенном порядке одна за другой
различные аминокислоты, формируя
соответствующую аминокислотную
последовательность синтезируемого
белка.







